Bývalý šéf banky v Moskve Andrej Borodin a jeho bývalý zástupca Dmitrij Akulinin sú podozriví z podvodných transakcií s rozpočtom hlavného mesta vo výške 12,76 miliárd rubľov, ako aj zo sprenevery bankových prostriedkov vo výške viac ako 7 miliárd rubľov.
Problémy pre vodcov Moskovskej banky začali okamžite po tom, čo nová vláda Moskvy predala mestský podiel na kapitále tejto inštitúcie (46, 48%) štátnej banke VTB. O nejaký čas neskôr signalizoval vysoký podiel pochybných pôžičiek v portfóliu Bank of Moscow.
Koncom roku 2010 sa o banku začali zaujímať vyšetrovacie orgány. V tom čase sa sledoval aj pochybný finančný tok. V roku 2009 finančná inštitúcia získala z rozpočtu hlavného mesta 15 miliárd rubľov na zvýšenie svojho kapitálu. Potom banka v Moskve vydala 13 miliárd spoločnosti "Premier Estate", ktorej základné imanie v deň prijatia pôžičky bolo minimálne prípustné 10 tisíc rubľov. Prijatý úver zase použila na kúpu pozemkov v západnej časti Moskvy od spoločnosti Inteko, ktorú vlastní manželka exprimátora Moskvy Elena Baturina. Podľa odborníkov bola zároveň suma transakcie za nákup 58 hektárov pôdy niekoľkonásobne vyššia ako skutočné trhové ceny.
Vyšetrovatelia sa veľmi dlho pokúšali predvolať na výsluch samotnú Elenu Baturinu, ktorá žije a podniká v Rakúsku. Ale odmietla prísť v obave, že po výsluchu sa už nevráti. Iba v júni 2012 navštívila Moskvu po tom, čo jej bola pravidelne zasielaná záruka imunity. Elena Baturina vypovedala pred vyšetrovateľmi štyri hodiny, potom sa jej postavenie svedka v tomto prípade nezmenilo.
Pokiaľ ide o Borodin a Akulinin, neskôr vyšetrovanie odhalilo druhú schému krádeže. V rokoch 2008 - 2010 títo vrcholoví manažéri zorganizovali prevod asi 7,8 miliárd rubľov z korešpondenčného účtu Bank of Moscow na účty dvadsiatich nimi kontrolovaných spoločností registrovaných na Cypre. Predpokladá sa, že podozriví sú v Anglicku. Doma, kde boli zatknutí v neprítomnosti a zaradení na medzinárodný zoznam hľadaných, hrozí im dlhodobé väzenie.
